RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIC13	Q5XKP0	118 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PRX2	142 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSG1	P11464	419 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARL3	P36405	182 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX261	Q6UWH6	196 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMED6	Q8WW62	240 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMPR1B	O00238	502 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPP1	P10451	314 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTN1A1	Q13410	526 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB136	Q30KP8	78 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	STPG3	Q8N7X2	389 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	RD3L	P0DJH9	198 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF616	Q08AN1	781 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUDT19	A8MXV4	375 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR2C1	O95371	312 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00869	P0C866	280 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SELENOT	P62341	195 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR20E	P86478	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR20C	P86479	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR20D	P86480	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR20B	P86481	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR20A	P86496	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF98	A6NK75	572 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCGB2A1	O75556	95 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	YIF1A	O95070	293 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOMM40	O96008	361 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM209B	Q5JX69	171 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUX3	Q96PT4	197 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087WW49	117 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPAN15	O95858	294 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	FABP1	P07148	127 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR11H1	Q8NG94	326 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q8WTZ3	238 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	VSIR	Q9H7M9	311 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL4	P05112	153 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERF2	P84101	59 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZRG5	221 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	DOK5	Q9P104	306 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ORM2	P19652	201 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	LYZ	P61626	148 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPEL1	Q2QD12	228 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	FHIT	P49789	147 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB2A	P61019	212 aa		7.02	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms