RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 PLP1P60201 277 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CX3CL1P78423 397 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FMC1Q96HJ9 113 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CADP27708 2225 aa7.36□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 OOSP1A8MZH6 123 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 E7EUB6 86 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 MOSP00540 346 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PLAUP00749 431 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 GZMBP10144 247 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ESDP10768 282 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SFTPCP11686 197 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ORM2P19652 201 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 COL8A2P25067 703 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DDTP30046 118 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 Q0VG73 95 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM209BQ5JX69 171 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 HCP5Q6MZN7 132 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 BAGE3Q86Y29 109 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 BAGE2Q86Y30 109 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ATG101Q9BSB4 218 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA1BQ00975 2339 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ACACAQ13085 2346 aa7.35□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PLCE1Q9P212 2302 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX22C9J3V5 150 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 LY6LH3BQJ8 138 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 NBR2O15453 112 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 CNIH1O95406 144 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PYYP10082 97 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 S100A7P31151 101 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5I1Q13606 314 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 MMDQ15546 238 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 PATE2Q6UY27 113 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A10Q96PG2 267 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXL15Q9H469 300 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 DPM3Q9P2X0 92 aa7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
EFTUD2-222ENST00000592408 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 C22orf46C9J442 243 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMM23O14925 209 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 SCGB1D1O95968 90 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV2-8P01709 118 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 LYNX1P0DP58 116 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 GP9P14770 177 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 MYCNOSP40205 109 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB4BP61018 213 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 LYZP61626 148 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 FXYD3Q14802 87 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 CT83Q5H943 113 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 MORN5Q5VZ52 161 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 NPBQ8NG41 125 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 RITA1Q96K30 269 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM68Q96MH6 324 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 OTORQ9NRC9 128 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF492Q9P255 531 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 NAGKQ9UJ70 344 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 EPDR1Q9UM22 224 aa7.33□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 ODF3BA8MYP8 253 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms