RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PSG1P11464 419 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 FGF7P21781 194 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PLP1P60201 277 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 OPCMLQ14982 345 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 REC114Q7Z4M0 266 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 C1QL4Q86Z23 238 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 Q8WTZ3 238 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.81□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 A8MWP6 167 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 K7EMT4 169 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 M0QZ24 198 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 LINC00869P0C866 280 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 C4BPBP20851 252 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 SLURP1P55000 103 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PRR20EP86478 221 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PRR20CP86479 221 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PRR20DP86480 221 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PRR20BP86481 221 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PRR20AP86496 221 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 DUX3Q96PT4 197 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 GINS3Q9BRX5 216 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.8□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 ZNF709Q8N972 641 aa8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 STOML3Q8TAV4 291 aa8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PF4P02776 101 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 IL4P05112 153 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 ATP6V0CP27449 155 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 SYNJ2BPP57105 145 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 SERF2P84101 59 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 MIC13Q5XKP0 118 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 SLC51BQ86UW2 128 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 STPG3Q8N7X2 389 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 RNF125Q96EQ8 232 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 RSG1Q9BU20 258 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PEMTQ9UBM1 199 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.78□□□□□ -1
GGA3-211ENST00000582232 OVOL1O14753 267 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 YIF1AO95070 293 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 TSPAN15O95858 294 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 C8orf88P0DMB2 117 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 CRYBB3P26998 211 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 B2MP61769 119 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZRG5 221 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 BAP18Q8IXM2 172 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 ZNF320A2RRD8 509 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 TMEM213A2RRL7 107 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 SEC11BP0C7V7 166 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 SPP1P10451 314 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 LYZP61626 148 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 MARC2Q969Z3 335 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 METTL26Q96S19 204 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 PFDN5Q99471 154 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.76□□□□□ -1.01
GGA3-211ENST00000582232 RABAC1Q9UI14 185 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms