RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 U3KQ87 197 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 WRBO00258 174 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 ADAP1O75689 374 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFB6O95139 128 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 IFNA4P05014 189 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PSG1P11464 419 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 SLC25A4P12235 298 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 IL7P13232 177 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 P2RY1P47900 373 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 INPP1P49441 399 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 DEFB131AP59861 70 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PAFAH1B2P68402 229 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 SRPXP78539 464 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF90Q03938 601 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 GAMTQ14353 236 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 DEFB135Q30KP9 77 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 LCE3BQ5TA77 95 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TRIQKQ629K1 86 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 METTL26Q96S19 204 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 SPRY2O43597 315 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 OR4E1P0C645 316 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 RD3LP0DJH9 198 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 STPG3Q8N7X2 389 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 RABAC1Q9UI14 185 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 A0A0J9YWU9 116 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 A0A1W2PS18 150 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 K7EQG2 157 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 SYNGR2O43760 224 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TOMM40O96008 361 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 IL4P05112 153 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 SLC25A6P12236 298 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 APOC4P55056 127 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 DHRS2Q13268 280 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 OR2F1Q13607 317 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 Q6ZWC4 215 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 NOXA1Q86UR1 476 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 GLMPQ8WWB7 406 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 RNF183Q96D59 192 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 CSTL1Q9H114 145 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 KNCNA6PVL3 124 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 H3BP45 60 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 UBE2CO00762 179 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 BUB3O43684 328 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF688P0C7X2 276 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 LYG2Q86SG7 212 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 DCANP1Q8TF63 244 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 ZFP92A6NM28 416 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 CENPXA8MT69 81 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PRSS46E5RG02 174 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 MED6O75586 246 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 CCNKO75909 580 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 CD5P06127 495 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 BMI1P35226 326 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PAX9P55771 341 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 RAB11AP62491 216 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 C4orf46Q504U0 113 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 IL17DQ8TAD2 202 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 RNF125Q96EQ8 232 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 KMT2AQ03164 3969 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-211ENST00000581536 LYRM1O43325 122 aa7.09□□□□□ -1.27
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