RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBG1P69891 147 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBG2P69892 147 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIPP09681 153 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A11P31949 105 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL26Q96S19 204 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPPCP23582 126 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD2Q9UBB5 411 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH3Q8TD57 4116 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 IZUMO1RA6ND01 250 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 GP9P14770 177 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMI1P35226 326 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LILRB2Q8N423 598 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHEK1O14757 476 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYBB3P26998 211 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEPPQ6URK8 271 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF125Q96EQ8 232 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR25Q96S07 402 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAXQ07812 192 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM61Q8N0U2 210 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 THAP6Q8TBB0 222 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SELENOKQ9Y6D0 94 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFDP00746 253 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYL1P12980 280 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAP2BP61225 183 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 NHLH2Q02577 135 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGL1Q08830 312 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2F1Q13607 317 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 VSIRQ9H7M9 311 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 UQCC1Q9NVA1 299 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOHP02749 345 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V1FQ16864 119 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 VWC2Q2TAL6 325 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV25A0A0B4J276 109 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PS18 150 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF2Q99496 336 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM147Q9BVK8 224 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 RABAC1Q9UI14 185 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 BPIFCQ8NFQ6 507 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST8SIA2Q92186 375 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 PBDC1Q9BVG4 233 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM231Q9H6L2 316 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYZP61626 148 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SELENOTP62341 195 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5C1Q8NGR4 320 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF785A8K8V0 405 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 U3KQE9 123 aa24.92■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD5P06127 495 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL12P30050 165 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 GUCA2BQ16661 112 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR83OSQ9Y284 106 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EIL1 84 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN4O14817 238 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFDN2Q9UHV9 154 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGPAT2O15120 278 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB31Q13636 194 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF546Q86UE3 836 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T35Q8NGX2 323 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRAMD2BQ96HH9 432 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPB11Q9Y547 144 aa24.89■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q5BKY6 102 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM90A2PQ658T7 463 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MGST2Q99735 147 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZNX1 250 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCF24Q7RTU0 167 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTSCR1Q86UQ5 136 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRAPQ8TCY5 172 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHAC2Q8WUX2 184 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 BUB3O43684 328 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLINT1Q14677 625 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC45A2Q9UMX9 530 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 DFFBO76075 338 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00869P0C866 280 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMLGP49069 296 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 ORM2P19652 201 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPDU1O75352 247 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLP1P60201 277 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf54Q6UWD8 224 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1B1Q8NGR6 318 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGTLC1Q9BX51 225 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF7P21781 194 aa24.82■■□□□ 1.56
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