RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574026.2

ITGAE-209, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 3

Gene ITGAE, Length 416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-209ENST00000574026 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.6□□□□□ -1.83
ITGAE-209ENST00000574026 PRO1933Q9H354 126 aa3.6□□□□□ -1.83
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ITGAE-209ENST00000574026 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.6□□□□□ -1.83
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ITGAE-209ENST00000574026 SVIPQ8NHG7 77 aa3.59□□□□□ -1.83
ITGAE-209ENST00000574026 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.59□□□□□ -1.83
ITGAE-209ENST00000574026 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
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ITGAE-209ENST00000574026 SFRP2Q96HF1 295 aa3.59□□□□□ -1.83
ITGAE-209ENST00000574026 SLC35E1Q96K37 410 aa3.59□□□□□ -1.83
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ITGAE-209ENST00000574026 IGLV2-8P01709 118 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 IGHV1-69P01742 117 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 CRYGBP07316 175 aa3.58□□□□□ -1.84
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ITGAE-209ENST00000574026 C8orf88P0DMB2 117 aa3.58□□□□□ -1.84
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ITGAE-209ENST00000574026 MMDQ15546 238 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 FAM209BQ5JX69 171 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 DNLZQ5SXM8 178 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 HCP5Q6MZN7 132 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.58□□□□□ -1.84
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ITGAE-209ENST00000574026 TBX15Q96SF7 602 aa3.58□□□□□ -1.84
ITGAE-209ENST00000574026 IMMP2LQ96T52 175 aa3.58□□□□□ -1.84
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ITGAE-209ENST00000574026 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.58□□□□□ -1.84
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