RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00311Q8N616 119 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF738Q8NE65 137 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TRGV9Q99603 122 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 MLST8Q9BVC4 326 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF492Q9P255 531 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 NCOR1O75376 2440 aa7.58□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LTAP01374 205 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 MC5RP33032 325 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM27E3Q08E93 113 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 OR4C46A6NHA9 309 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C22orf46C9J442 243 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFB3O43676 98 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CEACAM4O75871 244 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 MUC15Q8N387 334 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ST20Q9HBF5 79 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C1RLQ9NZP8 487 aa7.57□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 DYSFO75923 2080 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C17orf100A8MU93 164 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PPIAL4DF5H284 164 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TCRAP04437 139 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LEMD1Q68G75 181 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 HCP5Q6MZN7 132 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 GTSF1Q8WW33 167 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 Q9H3A6 140 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CADP27708 2225 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CHEK1O14757 476 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL25O15444 150 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LEPROTL1O95214 131 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CRYGCP07315 174 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 GP9P14770 177 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LGALS7P47929 136 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2V1Q13404 147 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM231BA6NCW3 169 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF137PP52743 207 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR31Q5SQ13 230 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM178BH3BS89 294 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 M0QZ24 198 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM87AP0C7U9 286 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 FCN3O75636 299 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 LIPFP07098 398 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 OR5AL1P0C617 328 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 ADIPOQQ15848 244 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PIP4P1Q86T03 277 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 TEX45Q8NA69 505 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB124Q8NES8 71 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL17Q92583 94 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BTX0 84 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 CD24P25063 80 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 COL8A1P27658 744 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 PLP1P60201 277 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-202ENST00000546471 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms