RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 OR4C46A6NHA9 309 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 MT-CO2P00403 227 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PYYP10082 97 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CD40P25942 277 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR4A47Q6IF82 309 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 WDR82Q6UXN9 313 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 MBD6Q96DN6 1003 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.4□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 C15orf61A6NNL5 157 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 H0Y8G0 127 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 LYNX1P0DP58 116 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ERVK-16P61578 105 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 GNG5P63218 68 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR5B3Q8NH48 314 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ZNF596Q8TC21 504 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IGLV1-44P01699 117 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 RHOGP84095 191 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TCF24Q7RTU0 167 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.39□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 A0A087X0K7 114 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SNAI2O43623 268 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SAP30O75446 220 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-48P01763 117 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ZNF138P52744 262 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 NUDT11Q96G61 164 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PTPN13Q12923 2485 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 HIGD1CA8MV81 97 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 RBPJQ06330 500 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PNKDQ8N490 385 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 S1PR3Q99500 378 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SPINT2O43291 252 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PSG9Q00887 426 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TMEM11P17152 192 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 RIPPLY3P57055 190 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 LOXL3P58215 753 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 DDB2Q92466 427 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR2V2Q96R30 315 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 C19orf84I3L1E1 186 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ZNF137PP52743 207 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 RAB31Q13636 194 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 DEFB125Q8N687 156 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 LRRC29Q8WV35 223 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TCTAP57738 103 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms