RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.61□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PS18 150 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 L7N2F9 121 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 FABP1P07148 127 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 RD3LP0DJH9 198 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A10P60903 97 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 VAMP2P63027 116 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 RABAC1Q9UI14 185 aa8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPAN4O14817 238 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 DFFBO76075 338 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PAFAH1B2P68402 229 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 IFITM3Q01628 133 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2F1Q13607 317 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 GAMTQ14353 236 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.59□□□□□ -1.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TOMM40O96008 361 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 P2RY1P47900 373 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 BCAP31P51572 246 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 LYZP61626 148 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ID3Q02535 119 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 HAGHQ16775 308 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RCHY1Q96PM5 261 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB40CQ96S21 281 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 A8MZ25 164 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GOSR2O14653 212 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CD5P06127 495 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PSG1P11464 419 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF90Q03938 601 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF125Q96EQ8 232 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM8Q96KF7 97 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SPATA25Q9BR10 227 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.57□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SSNA1O43805 119 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CRYBB3P26998 211 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CAV2P51636 162 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 C2orf50Q96LR7 162 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 VSIRQ9H7M9 311 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RETNQ9HD89 108 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.56□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 HELTA6NFD8 242 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PRAF2O60831 178 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 TSC22D2O75157 780 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CCNKO75909 580 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 IL5P05113 134 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8N3U1 123 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 TRGV9Q99603 122 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 COL7A1Q02388 2944 aa8.55□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 C7orf66A4D0T2 115 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 K7EPK0 472 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 SIX6O95475 246 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 TAS2R30P59541 319 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 XP32Q5T750 250 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.54□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS46E5RG02 174 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CST7O76096 145 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ORM2P19652 201 aa8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
UBASH3B-208ENST00000533451 APOC4P55056 127 aa8.53□□□□□ -1.04
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