RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 GGTLC3B5MD39 225 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 H3BUA1 57 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 J3QLI3 93 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FCN1O00602 326 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 NPFFO15130 113 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF253O75346 499 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LY6HO94772 140 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGKV1-17P01599 117 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MT-ND6P03923 174 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CXCL1P09341 107 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 DEFA4P12838 97 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TMEM11P17152 192 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CNTFRP26992 372 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GNG4P50150 75 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CT83Q5H943 113 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 Q8N9W7 124 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 OCC1Q8TAD7 63 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 OTORQ9NRC9 128 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IL36BQ9NZH7 164 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FAM231BA6NCW3 169 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 RD3LP0DJH9 198 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PSG1P11464 419 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GP9P14770 177 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MEOX2P50222 304 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 UBE2G2P60604 165 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 S100A12P80511 92 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF90Q03938 601 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FMC1Q96HJ9 113 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GPR82Q96P67 336 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ATG101Q9BSB4 218 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 EPDR1Q9UM22 224 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 B4DSR2 109 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 H3BRN7 92 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PEX7O00628 323 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BKO60814 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 NDUFS7O75251 213 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGHV1-69P01742 117 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BJP06899 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BOP23527 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CRYBB3P26998 211 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BBP33778 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SAA4P35542 130 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BDP58876 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BCP62807 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 KLRD1Q13241 179 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HES1Q14469 280 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SMUG1Q53HV7 270 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CENPWQ5EE01 88 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 WDR73Q6P4I2 378 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF329Q86UD4 541 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ZNF492Q9P255 531 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 ACACBO00763 2458 aa5.94□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 FAM223BA6NKX1 122 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 GNG7O60262 68 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-211ENST00000531298 IGLV2-8P01709 118 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms