RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525152.1

PPP6R3-208, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-208	ENST00000525152	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	SRPX	P78539	464 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	LGI3	Q8N145	548 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	IGLL5	B9A064	214 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	DEDD	O75618	318 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	C4BPB	P20851	252 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	TNFSF8	P32971	234 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	RBKS	Q9H477	322 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152		X6R8D5	127 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	AGRN	O00468	2067 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PPP6R3-208	ENST00000525152	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	RNF125	Q96EQ8	232 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRR13	Q9NZ81	148 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152		H3BMM0	161 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	FABP1	P07148	127 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	GAMT	Q14353	236 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	AP3S2	P59780	193 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	RAB11A	P62491	216 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	OR1S1	Q8NH92	325 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	MCFD2	Q8NI22	146 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152		H3BMQ9	156 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PITX3	O75364	302 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLC25A6	P12236	298 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	ID1	P41134	155 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152		Q6ZTC4	211 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLC35E1	Q96K37	410 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	MED6	O75586	246 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRR20E	P86478	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRR20C	P86479	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRR20D	P86480	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRR20B	P86481	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRR20A	P86496	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF90	Q03938	601 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	NEU1	Q99519	415 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRGV9	Q99603	122 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PPP6R3-208	ENST00000525152	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	PSMB3	P49720	205 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	LYZ	P61626	148 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	TRIM63	Q969Q1	353 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	ISLR	O14498	428 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PPP6R3-208	ENST00000525152	SOCS3	O14543	225 aa		10.75	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms