RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520577.1

RASA4-208, Transcript of RAS p21 protein activator 4, human

TSL 4

Gene RASA4, Length 542 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASA4-208	ENST00000520577	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	MIF	P14174	115 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	C4BPB	P20851	252 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	AP3S2	P59780	193 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	GAMT	Q14353	236 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	PYDC2	Q56P42	97 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	NRN1	Q9NPD7	142 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	RNF125	Q96EQ8	232 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	PITX3	O75364	302 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	TCTA	P57738	103 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF90	Q03938	601 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577		X6R8D5	127 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	LRTM2	Q8N967	370 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577		V9GYH0	126 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RASA4-208	ENST00000520577	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577		H3BMM0	161 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	DEDD	O75618	318 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	FABP1	P07148	127 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	SLC25A6	P12236	298 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	RAB11A	P62491	216 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	IGLL5	B9A064	214 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	VAMP1	P23763	118 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	HLA-DMB	P28068	263 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	S100A5	P33763	92 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.69	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	MED6	O75586	246 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	IAPP	P10997	89 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF79	Q15937	498 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	SFT2D2	O95562	160 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	HLA-DRB4	P13762	266 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	ID1	P41134	155 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	LYZ	P61626	148 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	TRGV9	Q99603	122 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	APLN	Q9ULZ1	77 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	SYNGR2	O43760	224 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PPP1R1A	Q13522	171 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	OR2F1	Q13607	317 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577		Q6ZTC4	211 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	LINC00052	Q96N35	136 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	AGRN	O00468	2067 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	HOXB5	P09067	269 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PRR20E	P86478	221 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PRR20C	P86479	221 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PRR20D	P86480	221 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PRR20B	P86481	221 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PRR20A	P86496	221 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	THAP8	Q8NA92	274 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RASA4-208	ENST00000520577	WRB	O00258	174 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RASA4-208	ENST00000520577	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39

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