RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM24AA6NFZ4 105 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CHEK1O14757 476 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MPC2O95563 127 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 EDN2P20800 178 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CRYBB3P26998 211 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 S100A7P31151 101 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC38A11Q08AI6 406 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GTSCR1Q86UQ5 136 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MRAPQ8TCY5 172 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 PRR25Q96S07 402 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SELENOTP62341 195 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 BAXQ07812 192 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP6V1FQ16864 119 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TEPPQ6URK8 271 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF125Q96EQ8 232 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 VSIRQ9H7M9 311 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RABAC1Q9UI14 185 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNKO75909 580 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CST7O76096 145 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CXCL3P19876 107 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 FCN2Q15485 313 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM61Q8N0U2 210 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 LILRB2Q8N423 598 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 BPIFCQ8NFQ6 507 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TSPAN4O14817 238 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF90Q03938 601 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 FGL1Q08830 312 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB31Q13636 194 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 OR11H7Q8NGC8 314 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5AC2Q9NZP5 309 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 IGSF23A1L1A6 192 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 IZUMO1RA6ND01 250 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 K7EIL1 84 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GIPP09681 153 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ARL16Q0P5N6 197 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GUCA2BQ16661 112 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 THAP6Q8TBB0 222 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 UQCC1Q9NVA1 299 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC45A2Q9UMX9 530 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF785A8K8V0 405 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 H0YIZ8 118 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 S100A7AQ86SG5 101 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM217Q8N7C4 229 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF2Q99496 336 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM147Q9BVK8 224 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 U3KQE9 123 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PAFAH1B2P68402 229 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 VWC2Q2TAL6 325 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ST8SIA2Q92186 375 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 RAP2BP61225 183 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF546Q86UE3 836 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF126Q9BV68 326 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa20.17■□□□□ 0.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 OR4C46A6NHA9 309 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 LYL1P12980 280 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 LYZP61626 148 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2F1Q13607 317 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 DEFB121Q5J5C9 76 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PXDC1Q5TGL8 231 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 MPDU1O75352 247 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM90A2PQ658T7 463 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TCF24Q7RTU0 167 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 MBD2Q9UBB5 411 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF24Q9Y225 148 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAV2A0A0B4J234 112 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 APOHP02749 345 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf194Q5T5A4 169 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXL17Q9UF56 701 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR83OSQ9Y284 106 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2-212ENST00000508338 BUB3O43684 328 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 CD81P60033 236 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 PLP1P60201 277 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 NHLH2Q02577 135 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 C16orf54Q6UWD8 224 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5C1Q8NGR4 320 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 NEURL2Q9BR09 285 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL12P30050 165 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 Q8N1Y9 231 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 CHAC2Q8WUX2 184 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R14BQ96C90 147 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM110AQ9BQ89 295 aa20.13■□□□□ 0.81
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