RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497700.1

ELL3-208, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 3

Gene ELL3, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-208	ENST00000497700	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	RETN	Q9HD89	108 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	CORT	O00230	105 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	HAGH	Q16775	308 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SPP1	P10451	314 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	MLANA	Q16655	118 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	TMED6	Q8WW62	240 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700		A8MZ25	164 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	NMB	P08949	121 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	DEFA4	P12838	97 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	COMMD7	Q86VX2	200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	ZP3	P21754	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	FGF7	P21781	194 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	OPRK1	P41145	380 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	GAMT	Q14353	236 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ELL3-208	ENST00000497700	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	CYB5B	O43169	146 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	MPDU1	O75352	247 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700		I3L2K1	104 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	MT-CO2	P00403	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	PRH1	P02810	166 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	CSN3	P07498	182 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	SULT1A2	P50226	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700		H3BUA1	57 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700		K7EIM0	57 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	SERF2	P84101	59 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	NPIPB3	Q92617	1050 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	ACY3	Q96HD9	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	MGST2	Q99735	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	THYN1	Q9P016	225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700		A0A0G2JLM5	398 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	RND2	P52198	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	RAB31	Q13636	194 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	THAP8	Q8NA92	274 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ELL3-208	ENST00000497700	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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