RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497318.1

SUPT20H-223, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, human

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUPT20H-223	ENST00000497318	IL4	P05112	153 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	SLC25A4	P12235	298 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR10J1	P30954	320 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	RND3	P61587	244 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	EPM2A	B3EWF7	344 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	BUB3	O43684	328 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	HTR2B	P41595	481 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	PSG9	Q00887	426 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	GPR107	Q5VW38	600 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	GABARAP	O95166	117 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	RND2	P52198	227 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	CTDSP2	O14595	271 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	NUDT3	O95989	172 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	BSX	Q3C1V8	233 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	PSMB3	P49720	205 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	SPCS3	P61009	180 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	SPCS2	Q15005	226 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SUPT20H-223	ENST00000497318		F5H768	121 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	TOMM40	O96008	361 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	CLINT1	Q14677	625 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF79	Q15937	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	TRIM16L	Q309B1	348 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	COPZ2	Q9P299	210 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	RAB3D	O95716	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	UCP1	P25874	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	DEFB1	P60022	68 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	NOXA1	Q86UR1	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	NXPH3	O95157	252 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR5AC1	P0C628	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	PAX9	P55771	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	MEF2D	Q14814	521 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR52E5	Q8NH55	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	AP3S1	Q92572	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	ISLR	O14498	428 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	TAS2R19	P59542	299 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	B2M	P61769	119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	FAM219A	Q8IW50	185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SUPT20H-223	ENST00000497318	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms