RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 A0A1B0GU03 582 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 A0A1B0GV50 99 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 A0A1B0GW64 132 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PPE3 182 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 A6NDX4 124 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ZNF98A6NK75 572 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 B4DEV8 164 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 H0Y980 276 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C15orf65H3BRN8 121 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CHST1O43916 411 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 YPEL1O60688 119 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MBP02144 154 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SMIM6P0DI80 62 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SLC25A6P12236 298 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RAB5AP20339 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 S100PP25815 95 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CEACAM6P40199 344 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TAS2R30P59541 319 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ARL16Q0P5N6 197 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CATR1Q13166 79 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IL15RAQ13261 267 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MORN2Q502X0 79 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 Q6ZS49 121 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SMIM29Q86T20 159 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TMEM219Q86XT9 240 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 GAPTQ8N292 157 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LINC00311Q8N616 119 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SLC35G3Q8N808 338 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ZNF709Q8N972 641 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 THAP8Q8NA92 274 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR1L1Q8NH94 360 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LINC01006Q8NI28 216 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 UBALD1Q8TB05 177 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TMEM56Q96MV1 263 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 YPEL2Q96QA6 119 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 S1PR3Q99500 378 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TXN2Q99757 166 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ATP5SQ99766 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ARV1Q9H2C2 271 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C16orf95Q9H693 158 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 C15orf62A8K5M9 175 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PRSS46E5RG02 174 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 LY6LH3BQJ8 138 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RAB29O14966 203 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CST7O76096 145 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 NAPSAO96009 420 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MOSP00540 346 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGKV1D-33P01593 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGKV1-33P01594 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 IGLV2-11P01706 119 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ADCYAP1P18509 176 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CD24P25063 80 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ATP6V0CP27449 155 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CD1BP29016 333 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 REG1BP48304 166 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SULT1A1P50225 295 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HLA-DRB3P79483 266 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 HAGHQ16775 308 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 KHDC3LQ587J8 217 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 ZNF429Q86V71 674 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 DRAM1Q8N682 238 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 OR51H1Q8NH63 302 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 PIFOQ8TCI5 191 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 TVP23CQ96ET8 276 aa3.54□□□□□ -1.84
RBM39-240ENST00000495293 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms