RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 C11orf45Q8TAV5 145 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 FAM90A26D6RGX4 464 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 SPP1P10451 314 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 OR51G1Q8NGK1 321 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 X6R8D5 127 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 RBMY1CP0DJD4 496 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 ACTL10Q5JWF8 245 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 OR1S1Q8NH92 325 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 RNF125Q96EQ8 232 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 RAB40CQ96S21 281 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 AP3S2P59780 193 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF90Q03938 601 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM41BQ5BJD5 291 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 PSMG4Q5JS54 123 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 DEDD2Q8WXF8 326 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 NRN1Q9NPD7 142 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 IFNA4P05014 189 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A6P12236 298 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 MFFQ9GZY8 342 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R1AQ13522 171 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 FBXL17Q9UF56 701 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS46E5RG02 174 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 VAMP1P23763 118 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 SFT2D2O95562 160 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 IAPPP10997 89 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 LGALS9CQ6DKI2 356 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 OR8G2PQ6IF36 304 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 SRRQ9GZT4 340 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 HRH4Q9H3N8 390 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC5AQ9NY25 188 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35E1Q96K37 410 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 TMED3Q9Y3Q3 217 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 ZFP92A6NM28 416 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 H3BMM0 161 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 MIFP14174 115 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 S100A5P33763 92 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 THAP8Q8NA92 274 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 TRGV9Q99603 122 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC160A6NGH7 325 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 SOCS3O14543 225 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB1P60022 68 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 GDF5OSQ5U4N7 250 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 MAGT1Q9H0U3 335 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 DEDDO75618 318 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXB3-211ENST00000490677 SYNGR2O43760 224 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 HOXB5P09067 269 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DRB4P13762 266 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 RAB11AP62491 216 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 OR2F1Q13607 317 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 BAK1Q16611 211 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 GGNBP1Q5YKI7 109 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 GSG1LQ6UXU4 331 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 TBC1D24Q9ULP9 559 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 LYZP61626 148 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf194Q5T5A4 169 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 C2CD4CQ8TF44 421 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 SNRPGP15A8MWD9 76 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 MED6O75586 246 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf77Q96MU5 243 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 XCL2Q9UBD3 114 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 APLNQ9ULZ1 77 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 CELA1Q9UNI1 258 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 WRBO00258 174 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DMBP28068 263 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 PRR20EP86478 221 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 PRR20CP86479 221 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 PRR20DP86480 221 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 PRR20BP86481 221 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 PRR20AP86496 221 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 C9orf170A2RU37 121 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 ADAP1O75689 374 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFB6O95139 128 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXB3-211ENST00000490677 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms