RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487704.5

RTCB-205, Transcript of RNA 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH ligase, human

TSL 2

Gene RTCB, Length 767 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTCB-205	ENST00000487704	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704		H7BYZ3	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SLC17A2	O00624	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TNFSF8	P32971	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SLA	Q13239	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	MLANA	Q16655	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704		Q9HAA7	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704		C9JCJ5	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	LECT2	O14960	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	IL4	P05112	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	GADD45A	P24522	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	F2R	P25116	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	G6PC	P35575	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SNCA	P37840	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	HSPA13	P48723	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	ARPC4	P59998	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704		Q6ZTI0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PRAF2	O60831	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	TOMM40	O96008	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	MEOX2	P50222	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	CRYBA4	P53673	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	GAMT	Q14353	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	LAGE3	Q14657	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	HES5	Q5TA89	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704		Q8N976	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTCB-205	ENST00000487704	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	GYPE	P15421	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	MYL12A	P19105	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	PSMB9	P28065	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	OR10J1	P30954	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	OPRK1	P41145	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	RANBP1	P43487	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	LPAR6	P43657	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	CLDN12	P56749	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	FLOT2	Q14254	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	INSL4	Q14641	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704		A0A075B6Q4	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704		K7EQD1	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	CCNK	O75909	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	PPY	P01298	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	SRI	P30626	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	FCGR2C	P31995	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	WNT4	P56705	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTCB-205	ENST00000487704	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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