RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 ALDH3B2P48448 385 aa15.95■□□□□ 0.14
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PTPRN-215ENST00000484986 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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PTPRN-215ENST00000484986 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.93■□□□□ 0.14
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PTPRN-215ENST00000484986 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.92■□□□□ 0.14
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PTPRN-215ENST00000484986 ZNF767PQ75MW2 155 aa15.9■□□□□ 0.14
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PTPRN-215ENST00000484986 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRN-215ENST00000484986 PCLOQ9Y6V0 5065 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN-215ENST00000484986 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC160A6NGH7 325 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 ISLRO14498 428 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 LYZP61626 148 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 EBLN2Q6P2I7 272 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRN-215ENST00000484986 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.83■□□□□ 0.12
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