RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482071.1

NCK1-208, Transcript of NCK adaptor protein 1, human

TSL 3

Gene NCK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCK1-208	ENST00000482071	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCK1-208	ENST00000482071	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071		G3V318	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	NDUFB8	O95169	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	OR2C1	O95371	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	CTSG	P08311	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	RND2	P52198	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	B2M	P61769	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	RNF2	Q99496	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	THYN1	Q9P016	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071		C9JQL5	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	AP4M1	O00189	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TOMM40	O96008	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	IGHG4	P01861	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	PRH1	P02810	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	APELA	P0DMC3	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	PSMB3	P49720	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	MFAP4	P55083	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF90	Q03938	601 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	FOXE3	Q13461	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	LY6E	Q16553	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	GUK1	Q16774	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	PSG1	P11464	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	DEFA4	P12838	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZP3	P21754	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	PSMB8	P28062	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	NPBWR1	P48145	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	RHOB	P62745	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCK1-208	ENST00000482071	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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