RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 SLC45A2Q9UMX9 530 aa10.03□□□□□ -0.8
NISCH-208ENST00000481211 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 A0A087WW49 117 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PRX2 142 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 TRBV12-3P01733 135 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PSG1P11464 419 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PLP1P60201 277 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 SERF2P84101 59 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.02□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 REC114Q7Z4M0 266 aa10.02□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 RAX2Q96IS3 184 aa10.02□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 A8MWP6 167 aa10.01□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 K7EMT4 169 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 M0QZ24 198 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PRR20EP86478 221 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PRR20CP86479 221 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PRR20DP86480 221 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PRR20BP86481 221 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PRR20AP86496 221 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 ZNF90Q03938 601 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZRG5 221 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 TMEM190Q8WZ59 177 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PEMTQ9UBM1 199 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 TSPAN15O95858 294 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 MBP02144 154 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 PF4P02776 101 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 BMI1P35226 326 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 B2MP61769 119 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 DEFB136Q30KP8 78 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 BAP18Q8IXM2 172 aa10□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 STPG3Q8N7X2 389 aa10□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 OR1L4Q8NGR5 311 aa10□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 MDFIQ99750 246 aa9.98□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.98□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PS18 150 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 UMAD1C9J7I0 102 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 HYPMO75409 117 aa9.97□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 SLURP1P55000 103 aa9.97□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-208ENST00000481211 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.97□□□□□ -0.81
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NISCH-208ENST00000481211 OVOL1O14753 267 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 COX7A2P2O60397 106 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 CD5P06127 495 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 M6PRP20645 277 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 CRYBB3P26998 211 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 RAB5CP51148 216 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 SYNJ2BPP57105 145 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.96□□□□□ -0.82
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