RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 ASCL2Q99929 193 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 DNPH1O43598 174 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TOX4O94842 621 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 LEPROTL1O95214 131 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 MPV17P39210 176 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 U3KQA8 63 aa6.48□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 A0A1W2PRE2 83 aa6.47□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 GAGE10A6NGK3 116 aa6.47□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 NCR2O95944 276 aa6.47□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.47□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.47□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 H3BUT2 72 aa6.47□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.47□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 ST20Q9HBF5 79 aa6.47□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 FXYD7P58549 80 aa6.47□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.47□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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TPM3-215ENST00000469717 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.46□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.46□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 OR4S2Q8NH73 311 aa6.46□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
TPM3-215ENST00000469717 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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TPM3-215ENST00000469717 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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TPM3-215ENST00000469717 GTSF1Q8WW33 167 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 TMEM186Q96B77 213 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.46□□□□□ -1.38
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TPM3-215ENST00000469717 DSCAMO60469 2012 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 C15orf65H3BRN8 121 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 CD5LO43866 347 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.46□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.46□□□□□ -1.38
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TPM3-215ENST00000469717 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 S1PR3Q99500 378 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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TPM3-215ENST00000469717 C15orf61A6NNL5 157 aa6.45□□□□□ -1.38
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TPM3-215ENST00000469717 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 JMJD1CQ15652 2540 aa6.45□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 G3V4G9 280 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 LYZL6O75951 148 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 OR2J3O76001 311 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 AGFG2O95081 481 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 ACP1P24666 158 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 PAX2Q02962 417 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 FAM201AQ5SY85 155 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 Q8IYB0 196 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 LRRC29Q8WV35 223 aa6.44□□□□□ -1.38
TPM3-215ENST00000469717 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.44□□□□□ -1.38
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