RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466244.1

RAB17-209, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAB17, Length 937 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-209	ENST00000466244	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244		A0A1W2PS18	150 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	OR4C46	A6NHA9	309 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	BUB3	O43684	328 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	FABP1	P07148	127 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	RAB32	Q13637	225 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	DEDD	O75618	318 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	VWC2	Q2TAL6	325 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	OR11H12	B2RN74	326 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	GOSR2	O14653	212 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	DFFB	O76075	338 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	P2RY1	P47900	373 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	DEFB125	Q8N687	156 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	CITED4	Q96RK1	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-209	ENST00000466244	SIX6	O95475	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	PLP1	P60201	277 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244		H0YIZ8	118 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244		L7N2F9	121 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	SULT1A1	P50225	295 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	SELENOT	P62341	195 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	VAMP2	P63027	116 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	AKR1C1	Q04828	323 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	HAGH	Q16775	308 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	HELT	A6NFD8	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244		K7EQG2	157 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	CAV2	P51636	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	S100A10	P60903	97 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	OXA1L	Q15070	435 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	TEPP	Q6URK8	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244		E5RGE8	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	SSNA1	O43805	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	PAFAH1B2	P68402	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	CST7	O76096	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	LYL1	P12980	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	CXCL3	P19876	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	S100A11	P31949	105 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	LYZ	P61626	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-209	ENST00000466244	OR2F1	Q13607	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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