RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 IL15RAQ13261 267 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 Q8NA96 180 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 Q8TCH9 128 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 EREGO14944 169 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 FGFRL1Q8N441 504 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.32□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 H0YIZ8 118 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 J3QR06 171 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CDKN1BP46527 198 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LYZP61626 148 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ADMP35318 185 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CCL20P78556 96 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TMEM177Q53S58 311 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 Q6ZR03 302 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LIME1Q9H400 295 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TMEM140Q9NV12 185 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPE3 182 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GAGE12BA1L429 117 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CRYBB3P26998 211 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF843Q8N446 348 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 CST9LQ9H4G1 147 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LY6EQ16553 131 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GAGE13Q4V321 117 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SPINK9Q5DT21 86 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.31□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 A0A0G2JLM5 398 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 C12orf77C9JDV5 145 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 F5H697 171 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 WISP2O76076 250 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MIC13Q5XKP0 118 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 APOMO95445 188 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PPP1R17O96001 155 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TSPOP30536 169 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF525Q8N782 197 aa6.3□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 WNT9BO14905 357 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LYNX1P0DP58 116 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SRD5A1P18405 259 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 FXYD3Q14802 87 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 RNF5Q99942 180 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 USF3Q68DE3 2245 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 PGPA6NDG6 321 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 A8MWV9 139 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 MSMBP08118 114 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ADCYAP1P18509 176 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 REG1BP48304 166 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZNF479Q96JC4 524 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SMPXQ9UHP9 88 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 YPEL1O60688 119 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms