RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 DTYMKP23919 212 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 TNFSF8P32971 234 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 HES5Q5TA89 166 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SLC17A2O00624 439 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 ALPLP05186 524 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZTI0 123 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 OR4A16Q8NH70 328 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 C16orf92Q96LL3 132 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 C20orf173Q96LM9 149 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0J9YXV3 536 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 H7BYZ3 331 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 PANO1I0J062 215 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 CCNKO75909 580 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 GYPEP15421 78 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 LPAR6P43657 344 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF415Q09FC8 603 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 INSL4Q14641 139 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 MLANAQ16655 118 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 HACD4Q5VWC8 232 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 IGLC1P0CG04 106 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 F2RP25116 425 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 SRIP30626 198 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 CLDN12P56749 244 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.65□□□□□ -1.02
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C9orf3-211ENST00000463372 PRO0255Q9UI72 69 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 RAB22AQ9UL26 194 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM235A6NFC5 223 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 PRAF2O60831 178 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 CD1AP06126 327 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 OR10J1P30954 320 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 FCGR2CP31995 323 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 MEOX2P50222 304 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP10-8P60410 259 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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C9orf3-211ENST00000463372 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.64□□□□□ -1.03
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C9orf3-211ENST00000463372 RANBP1P43487 201 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 SLAQ13239 276 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 IRGMA1A4Y4 181 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 PPYP01298 95 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 RD3LP0DJH9 198 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 PSMB9P28065 219 aa8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-211ENST00000463372 FXYD4P59646 89 aa8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-211ENST00000463372 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 Q8N976 141 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 FAM107BQ9H098 131 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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C9orf3-211ENST00000463372 FUT9Q9Y231 359 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 RLN1P04808 185 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 RND2P52198 227 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 CRYBA4P53673 196 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 WNT4P56705 351 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 OR10A3P58181 314 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 ARL6IP1Q15041 203 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 SLC35G3Q8N808 338 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 BAALCQ8WXS3 180 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 TOMM40O96008 361 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 OR5AC1P0C628 307 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf3-211ENST00000463372 PSG3Q16557 428 aa8.6□□□□□ -1.03
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