RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, human

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN18-208	ENST00000462996		A0A0J9YX75	114 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996		M0QYG6	137 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC25A4	P12235	298 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	FCN2	Q15485	313 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	COQ8A	Q8NI60	647 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	NPIPB3	Q92617	1050 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	PSG1	P11464	419 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	PRSS3	P35030	304 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	HTR2B	P41595	481 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	CLINT1	Q14677	625 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996		Q9H3A6	140 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	PI3	P19957	117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	RND3	P61587	244 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996		A8MTW9	85 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP5G1	P05496	136 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	ELK1	P19419	428 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	ATP5G3	P48201	142 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	SPCS3	P61009	180 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	AZU1	P20160	251 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	FRZB	Q92765	325 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	ACY3	Q96HD9	319 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPN18-208	ENST00000462996	CBY3	A6NI87	242 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ISLR	O14498	428 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ATG12	O94817	140 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	PGAM2	P15259	253 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	PIGP	P57054	158 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	SP6	Q3SY56	376 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	DOK5	Q9P104	306 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	TSPO	P30536	169 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	TMEM127	O75204	238 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996		M0R2Z0	102 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	RCVRN	P35243	200 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	UCP1	P25874	307 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	UPK3B	Q9BT76	320 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	INS	P01308	110 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	TGFBR1	P36897	503 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF90	Q03938	601 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ESRG	Q1W209	222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPN18-208	ENST00000462996	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPN18-208	ENST00000462996	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPN18-208	ENST00000462996	LINC00315	P59091	139 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPN18-208	ENST00000462996	B2M	P61769	119 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPN18-208	ENST00000462996	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPN18-208	ENST00000462996	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPN18-208	ENST00000462996	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPN18-208	ENST00000462996	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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