RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.66□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.66□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 IL22RA2Q969J5 263 aa14.66□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.66□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 U3KQ87 197 aa14.66□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.66□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 CTDSP2O14595 271 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 NXPH3O95157 252 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 IFNA10P01566 189 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 NMSQ5H8A3 153 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 RNF126Q9BV68 326 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.65□□□□□ -0.06
ELL3-202ENST00000433927 CTDSPLO15194 276 aa14.64□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 IL18Q14116 193 aa14.64□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.64□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 XCL2Q9UBD3 114 aa14.64□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.63□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 H3BMM0 161 aa14.63□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 PSG1P11464 419 aa14.63□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 CCR6P51684 374 aa14.63□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.63□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.63□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.63□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 C12orf74Q32Q52 190 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 LGI3Q8N145 548 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 DTD1Q8TEA8 209 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 RNF125Q96EQ8 232 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 CELA1Q9UNI1 258 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 HLA-DRB4P13762 266 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 SMCO1Q147U7 214 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 A0A0B4J2A0 478 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 AMBPP02760 352 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 SPCS2Q15005 226 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 PRR13Q9NZ81 148 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 ZFP92A6NM28 416 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 P0DMU3 169 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 FAM231AP0DMU4 169 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 FAM231CP0DMU5 169 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 ANXA3P12429 323 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 ID1P41134 155 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 SRPXP78539 464 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 SLC35E1Q96K37 410 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 NEU1Q99519 415 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 RBKSQ9H477 322 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-202ENST00000433927 TMEM189A5PLL7 270 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 FABP1P07148 127 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 AKR1C4P17516 323 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 LINC00052Q96N35 136 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 MCUBQ9NWR8 336 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 GAMTQ14353 236 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 OR1S1Q8NH92 325 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 PSMB3P49720 205 aa14.56□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 ZNF90Q03938 601 aa14.56□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.56□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.56□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 COQ8AQ8NI60 647 aa14.56□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 IGKV3-20P01619 116 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 LYZP61626 148 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.55□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.54□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.54□□□□□ -0.08
ELL3-202ENST00000433927 EMP1P54849 157 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms