RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 HRH4Q9H3N8 390 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 RBKSQ9H477 322 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 NRN1Q9NPD7 142 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 PRR13Q9NZ81 148 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 ZFP92A6NM28 416 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 H3BMQ9 156 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 BUB3O43684 328 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 PSG1P11464 419 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SLC35E1Q96K37 410 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 RAB40CQ96S21 281 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 SOSTQ9BQB4 213 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 RAB11AP62491 216 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 PYDC2Q56P42 97 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 Q8NAQ8 132 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 RNF125Q96EQ8 232 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-206ENST00000431413 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 S100A5P33763 92 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 MED6O75586 246 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 C4BPBP20851 252 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 VAMP1P23763 118 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 ID1P41134 155 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 GAMTQ14353 236 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 IGLL5B9A064 214 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 RBMY1CP0DJD4 496 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A6P12236 298 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 C1orf194Q5T5A4 169 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 CLEC5AQ9NY25 188 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 X6R8D5 127 aa11□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 CCDC160A6NGH7 325 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 HLA-DMBP28068 263 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 LRTM2Q8N967 370 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 TRIM63Q969Q1 353 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.99□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 AGRNO00468 2067 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 H3BMM0 161 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 PITX3O75364 302 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 DEDDO75618 318 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 CFDP00746 253 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 HLA-DRB4P13762 266 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 LYZP61626 148 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 ZNF90Q03938 601 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 TRGV9Q99603 122 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 XCL2Q9UBD3 114 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.98□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 IAPPP10997 89 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 S100A7P31151 101 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 COQ8AQ8NI60 647 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 LINC00052Q96N35 136 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 V9GYH0 126 aa10.97□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 SYNGR2O43760 224 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 SFT2D2O95562 160 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 INPP1P49441 399 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 PSMB3P49720 205 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 OR2F1Q13607 317 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 FOXI2Q6ZQN5 318 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZTC4 211 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 APLNQ9ULZ1 77 aa10.96□□□□□ -0.65
HERC3-206ENST00000431413 MEOX2P50222 304 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R1AQ13522 171 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 TMEM189A5PLL7 270 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 SMIM9A6NGZ8 99 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 WRBO00258 174 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 ISLRO14498 428 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 HOXB5P09067 269 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 GALR1P47211 349 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HERC3-206ENST00000431413 ZNF79Q15937 498 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms