RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430918.5

HDLBP-217, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene HDLBP, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-217ENST00000430918 AKAIN1P0CW23 69 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SMIM18P0DKX4 95 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 P0DMU3 169 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 FAM231AP0DMU4 169 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 FAM231CP0DMU5 169 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 HLA-DRB4P13762 266 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 NMSQ5H8A3 153 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 RNF125Q96EQ8 232 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 LINC00052Q96N35 136 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 A0A1B0GVY2 172 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ZFP92A6NM28 416 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF90Q03938 601 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 IL18Q14116 193 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 NOXA1Q86UR1 476 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 LGI3Q8N145 548 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 DTD1Q8TEA8 209 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 RBKSQ9H477 322 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 DNAH2Q9P225 4427 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 RTL8CO15255 209 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 CCR6P51684 374 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 LYZP61626 148 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SMCO1Q147U7 214 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SPCS2Q15005 226 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 COQ8AQ8NI60 647 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 IL22RA2Q969J5 263 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 PRRT1Q99946 306 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 U3KQ87 197 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 F6UB75 175 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SOCS3O14543 225 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 AKR1C4P17516 323 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ID1P41134 155 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 OR2F1Q13607 317 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 GAMTQ14353 236 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF709Q8N972 641 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SLC35E1Q96K37 410 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 NEU1Q99519 415 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 RFNGQ9Y644 331 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 A0A0B4J2A0 478 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 TMEM189A5PLL7 270 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 CTDSPLO15194 276 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 IFNA21P01568 189 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 HTN3P15516 51 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 PSMB3P49720 205 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 GPR141Q7Z602 305 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 OR1S1Q8NH92 325 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 MCUBQ9NWR8 336 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 DKK2Q9UBU2 259 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-217ENST00000430918 IAPPP10997 89 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-217ENST00000430918 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-217ENST00000430918 PSG9Q00887 426 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.8 ms