RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.39□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.38□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.37□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNIH1O95406 144 aa7.37□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TREM1Q9NP99 234 aa7.37□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 KHDC3LQ587J8 217 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIC13Q5XKP0 118 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM219Q86XT9 240 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STPG3Q8N7X2 389 aa7.36□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 STAG3L3P0CL85 134 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCL2P10415 239 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR10J1P30954 320 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPT1P50897 306 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDPQ00604 133 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ICAM4Q14773 271 aa7.35□□□□□ -1.23
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 LCN15Q6UWW0 184 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPIPB3Q92617 1050 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM68Q96MH6 324 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRGV9Q99603 122 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.34□□□□□ -1.23
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