RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A7P31151 101 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF2Q99496 336 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 B9D2Q9BPU9 175 aa11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 VSIRQ9H7M9 311 aa11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF125Q96EQ8 232 aa11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 A8MZ25 164 aa11.55□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 SULT1A1P50225 295 aa11.55□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF90Q03938 601 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 MED28Q9H204 178 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.54□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 APOHP02749 345 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 CD7P09564 240 aa11.54□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A11P31949 105 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 P2RY1P47900 373 aa11.54□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 TEPPQ6URK8 271 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A7AQ86SG5 101 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 U3KQE9 123 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11H12B2RN74 326 aa11.53□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCNKO75909 580 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 CST7O76096 145 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1FQ16864 119 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 LILRB2Q8N423 598 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.52□□□□□ -0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARL16Q0P5N6 197 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM110AQ9BQ89 295 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL17Q9UF56 701 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.51□□□□□ -0.57
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PGGT1B-202ENST00000379615 TFPI2P48307 235 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 BAXQ07812 192 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 OXA1LQ15070 435 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF546Q86UE3 836 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 ASB13Q8WXK3 278 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 IGSF23A1L1A6 192 aa11.5□□□□□ -0.57
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PGGT1B-202ENST00000379615 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB125Q8N687 156 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.5□□□□□ -0.57
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