RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 COQ2Q96H96 371 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF714Q96N38 554 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-201ENST00000372616 C15orf65H3BRN8 121 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MGST3O14880 152 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SPINK4O60575 86 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT3O95989 172 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV2-8P01709 118 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf83Q53S99 150 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MPV17L2Q567V2 206 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MDP1Q86V88 176 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 UBALD1Q8TB05 177 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GW15 77 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GXF2 115 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GGTLC3B5MD39 225 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM17P0DL12 118 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IGFBP2P18065 325 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GCSHP23434 173 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PRCDQ00LT1 54 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ATOH7Q8N100 152 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF492Q9P255 531 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ESPL1Q14674 2120 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE10A6NGK3 116 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CORTO00230 105 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PEX7O00628 323 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FOXH1O75593 365 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC3BP05452 202 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GPR183P32249 361 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SSTR5P35346 364 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ARL3P36405 182 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CSN1S1P47710 185 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 28.9
CTPS1-201ENST00000372616 RBPJQ06330 500 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C3AR1Q16581 482 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 LCN12Q6JVE5 192 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 DDB2Q92466 427 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 USF3Q68DE3 2245 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 HIGD1CA8MV81 97 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 K7EM74 188 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PRRG2O14669 202 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SIVA1O15304 175 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SCGB1A1P11684 91 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35B1P78383 322 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 KLRB1Q12918 225 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPB3Q92617 1050 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FMC1Q96HJ9 113 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 H3BRM9 83 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 COX7A2P2O60397 106 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ELANEP08246 267 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IGLC1P0CG04 106 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 COX8AP10176 69 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PSG1P11464 419 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 WDR82Q6UXN9 313 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 Q8NA96 180 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 GPR82Q96P67 336 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 PAXXQ9BUH6 204 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
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