RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35E1Q96K37 410 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf50Q96LR7 162 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 K7EMT4 169 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN4O14817 238 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SSSCA1O60232 199 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 TSC22D2O75157 780 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 CLN5O75503 358 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB1D2O95969 90 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 S100A7AQ86SG5 101 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM8Q96KF7 97 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 OR10C1Q96KK4 312 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GGACTQ9BVM4 153 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 NMES1Q9C002 83 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf66A4D0T2 115 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 OR4C46A6NHA9 309 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 FNDC10F2Z333 226 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 NXPH3O95157 252 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IAPPP10997 89 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 OR10J1P30954 320 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 STX12Q86Y82 276 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 Q8WTZ3 238 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RNF2Q99496 336 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PSENENQ9NZ42 101 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SMPXQ9UHP9 88 aa5.71□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PS18 150 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MPTX1A8MV57 137 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 GOSR2O14653 212 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 CHEK1O14757 476 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM50AO95807 157 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RND2P52198 227 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 S100A10P60903 97 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 HBG1P69891 147 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 HBG2P69892 147 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RAB31Q13636 194 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ACY3Q96HD9 319 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 METTL26Q96S19 204 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MED28Q9H204 178 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RNF24Q9Y225 148 aa5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP92A6NM28 416 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 E5RGE8 158 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 CCSO14618 274 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IGLC1P0CG04 106 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RD3LP0DJH9 198 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 BCAP31P51572 246 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 CAV2P51636 162 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 APOC4P55056 127 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOTP62341 195 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 DLK1P80370 383 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 AKR1C1Q04828 323 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 BAXQ07812 192 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 FGL1Q08830 312 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 OXA1LQ15070 435 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ST8SIA2Q92186 375 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 H3BP45 60 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 K7EPK0 472 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 DEDDO75618 318 aa5.68□□□□□ -1.5
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