RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 FOLR2P14207 255 aa10.04□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 EDN2P20800 178 aa10.04□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 CBLN1P23435 193 aa10.04□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 NOTCH1P46531 2555 aa10.04□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 IL4P05112 153 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SELENOTP62341 195 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ST6GAL2Q96JF0 529 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 MPDU1O75352 247 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 CRYBB3P26998 211 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF546Q86UE3 836 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 RNF125Q96EQ8 232 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 METTL26Q96S19 204 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 MGST2Q99735 147 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ATP5SQ99766 215 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SMPXQ9UHP9 88 aa10.02□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GVG6 124 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 RNF222A6NCQ9 220 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 SMLR1H3BR10 107 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 AGPAT2O15120 278 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 DFFBO76075 338 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 OR2F1Q13607 317 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 CLINT1Q14677 625 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 BTNL8Q6UX41 500 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 TCTE3Q8IZS6 198 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 BPIFCQ8NFQ6 507 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 VSIRQ9H7M9 311 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 MLXQ9UH92 298 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 SLC45A2Q9UMX9 530 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 U3KQE9 123 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 CHEK1O14757 476 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 NPPCP23582 126 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 BMI1P35226 326 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 CAMLGP49069 296 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PLP1P60201 277 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 RAB31Q13636 194 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 RABAC1Q9UI14 185 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 DNAH3Q8TD57 4116 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PS18 150 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 HMSDA8MTL9 139 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00869P0C866 280 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 FGF7P21781 194 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 LYZP61626 148 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PRR20EP86478 221 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PRR20CP86479 221 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PRR20DP86480 221 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PRR20BP86481 221 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PRR20AP86496 221 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 OPCMLQ14982 345 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM3Q9BZL3 60 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 FBXL17Q9UF56 701 aa10□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 ARPC5O15511 151 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF345Q14585 488 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 LCN12Q6JVE5 192 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 AKAP14Q86UN6 197 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 ST8SIA2Q92186 375 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 WFDC1Q9HC57 220 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 BUB3O43684 328 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC42-201ENST00000293845 CD5P06127 495 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms