RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP92A6NM28 416 aa7.34□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 G3V318 75 aa7.34□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXC2Q99958 501 aa7.34□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.34□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 AP4M1O00189 453 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 PMS2P11Q13670 270 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 AWAT1Q58HT5 328 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4X1Q8NH49 305 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 STAG3L2P0CL84 134 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 STAG3L3P0CL85 134 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV4-59P01825 116 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZS46 218 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC11CQ9BY50 192 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-17P01599 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 IER3P46695 156 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.31□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.31□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.3□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGF1P05019 195 aa7.3□□□□□ -1.24
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RABGEF1-201ENST00000284957 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 VAX2Q9UIW0 290 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 TSTD3H0UI37 97 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-23P01764 117 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-ND4LP03901 98 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMB3P49720 205 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6YL49 198 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.3□□□□□ -1.24
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