RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 HIF1ANQ9NWT6 349 aa21.16■□□□□ 0.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00869P0C866 280 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPWQ5EE01 88 aa21.15■□□□□ 0.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 JMJD1CQ15652 2540 aa21.14■□□□□ 0.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa21.08■□□□□ 0.97
CAPNS1-201ENST00000246533 CT45A3Q8NHU0 189 aa21.08■□□□□ 0.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf58Q2M2W7 97 aa21.08■□□□□ 0.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 AMTP48728 403 aa21.05■□□□□ 0.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR7C2O60412 319 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTL6BO94805 426 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTDAPP60985 99 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC1Q8N7A1 406 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N976 141 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF439Q8NDP4 499 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa21.04■□□□□ 0.96
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