RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 UBE2CO00762 179 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 PHOX2AO14813 284 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 TGOLN2O43493 480 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HLA-DRB1P01911 266 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 AP4M1O00189 453 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 RD3LP0DJH9 198 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 LYZP61626 148 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 CENPWQ5EE01 88 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF329Q86UD4 541 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 SPG11Q96JI7 2443 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PPQ1 181 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 GP9P14770 177 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 MYCNOSP40205 109 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 GNG4P50150 75 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 AKR1D1P51857 326 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 LEMD1Q68G75 181 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 NRGNQ92686 78 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 S4R3C0 116 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BKO60814 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BJP06899 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BOP23527 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BBP33778 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BDP58876 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BCP62807 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 IMMP2LQ96T52 175 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 FRZBQ92765 325 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 F8W735 103 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV1-69P01742 117 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 FABP1P07148 127 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 FOXL1Q12952 345 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC11-201ENST00000243082 NDUFB8O95169 186 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TOMM40O96008 361 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 IGLV2-8P01709 118 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 MFAP4P55083 255 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 RANP62826 216 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 OR5I1Q13606 314 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 BLNKQ8WV28 456 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 LINC00479Q96M42 142 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 PPP5D1E7EU14 171 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TRGC1P0CF51 173 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 GNG7O60262 68 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TYMSP04818 313 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 THYN1Q9P016 225 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 PEX7O00628 323 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 OR2J3O76001 311 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 PAX1P15863 534 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TAS2R60P59551 318 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 GCGP01275 180 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 NDUFA6P56556 154 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 PIFOQ8TCI5 191 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 PGPA6NDG6 321 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 SLC17A3O00476 420 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 ATP6V0E1O15342 81 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 RNF125Q96EQ8 232 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 EPDR1Q9UM22 224 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 LINC01548A6NM66 108 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC11-201ENST00000243082 H3BRN7 92 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms