RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1W2PRE2 83 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF727A8MUV8 499 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V0E1O15342 81 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 SCGB2A1O75556 95 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 TOMM40O96008 361 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 TGFAP01135 160 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 AMY1AP04745 511 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 CEBPGP53567 150 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V0BQ99437 205 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.48□□□□□ -1.21
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APOBEC1-201ENST00000229304 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 DOK5Q9P104 306 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 NAT8Q9UHE5 227 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF580Q9UK33 172 aa7.48□□□□□ -1.21
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APOBEC1-201ENST00000229304 PSG1P11464 419 aa7.47□□□□□ -1.21
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APOBEC1-201ENST00000229304 NPPCP23582 126 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP5G3P48201 142 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.47□□□□□ -1.21
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APOBEC1-201ENST00000229304 CST9LP1Q5W188 147 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 S100A7AQ86SG5 101 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 OR5T1Q8NG75 326 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 UHRF2Q96PU4 802 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 PARLQ9H300 379 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 OR51M1Q9H341 326 aa7.47□□□□□ -1.21
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APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 PRELID1Q9Y255 219 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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APOBEC1-201ENST00000229304 FBN2P35556 2912 aa7.46□□□□□ -1.21
APOBEC1-201ENST00000229304 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.46□□□□□ -1.22
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APOBEC1-201ENST00000229304 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 PLXNB1O43157 2135 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 TSPAN4O14817 238 aa7.45□□□□□ -1.22
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APOBEC1-201ENST00000229304 ECSCRQ19T08 205 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 OR5R1Q8NH85 324 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 Q8WTZ3 238 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 FXYD5Q96DB9 178 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF24Q9Y225 148 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM223BA6NKX1 122 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC01548A6NM66 108 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 COLCA2A8K830 154 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 C9JCJ5 164 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 NDUFB4O95168 129 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC1-201ENST00000229304 CTSGP08311 255 aa7.44□□□□□ -1.22
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