RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.61□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 A0A1B0GV50 99 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZFP92A6NM28 416 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 LINC00473A8K010 186 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 C15orf62A8K5M9 175 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF727A8MUV8 499 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 PRSS46E5RG02 174 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 F6UZH7 168 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 NXPH3O95157 252 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 IGKV1D-33P01593 117 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 IGKV1-33P01594 117 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 TYMSP04818 313 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CCL3L1P16619 93 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 NDUFB7P17568 137 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 FGF7P21781 194 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CD24P25063 80 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 S100PP25815 95 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 OPRK1P41145 380 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ERVK-16P61578 105 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 LRRC10Q5BKY1 277 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 LCN15Q6UWW0 184 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 SSX7Q7RTT5 188 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZFP82Q8N141 532 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 DPF1Q92782 380 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CORO2AQ92828 525 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 RAX2Q96IS3 184 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM210BQ96KR6 192 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 OR51M1Q9H341 326 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 VSIRQ9H7M9 311 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CALYQ9NYX4 217 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 DOK5Q9P104 306 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 GNG12Q9UBI6 72 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 RFNGQ9Y644 331 aa4.6□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 A0A1W2PPE3 182 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 C15orf61A6NNL5 157 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 PHOX2AO14813 284 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 PPP1R2P9O14990 202 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ST8SIA5O15466 376 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 PROP1O75360 226 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CXCL1P09341 107 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CD1BP29016 333 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 PKD1P98161 4303 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 BSXQ3C1V8 233 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF329Q86UD4 541 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 OR4A16Q8NH70 328 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB24Q969Q5 203 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 S1PR3Q99500 378 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM140Q9NV12 185 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 PSG11Q9UQ72 335 aa4.59□□□□□ -1.67
CHRNA4-218ENST00000637243 HERC1Q15751 4861 aa4.59□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 HSPG2P98160 4391 aa4.59□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 H7BYZ3 331 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 M0R1X1 148 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 HIST1H2BKO60814 126 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 FCGR3BO75015 233 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 CLN5O75503 358 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 HRASP01112 189 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 HIST1H2BJP06899 126 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 OR9G9P0C7N8 305 aa4.58□□□□□ -1.68
CHRNA4-218ENST00000637243 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms