RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00862A6NCI5 91 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RNF222A6NCQ9 220 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CGB1A6NKQ9 187 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 E7EUB6 86 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01619G3V211 115 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SSSCA1O60232 199 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SOX15O60248 233 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MYOD1P15172 320 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MYCNOSP40205 109 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF616Q08AN1 781 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 IL15RAQ13261 267 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SPINK9Q5DT21 86 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 STX12Q86Y82 276 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 STOML3Q8TAV4 291 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SLC35E1Q96K37 410 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM8Q96KF7 97 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR10C1Q96KK4 312 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 AQP10Q96PS8 301 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 KLK15Q9H2R5 256 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 PSENENQ9NZ42 101 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GW64 132 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 E5RGE8 158 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CCL24O00175 119 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TAAR5O14804 337 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GNG7O60262 68 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 NXPH3O95157 252 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 IAPPP10997 89 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 S100A7P31151 101 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 BMI1P35226 326 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 HBG1P69891 147 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 HBG2P69892 147 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RPEL1Q2QD12 228 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 BSXQ3C1V8 233 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 Q56UQ5 140 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ACSM6Q6P461 480 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MED9Q9NWA0 146 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 PEMTQ9UBM1 199 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MPTX1A8MV57 137 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 I3L521 148 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 K7EPK0 472 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 DEDDO75618 318 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MT-CO2P00403 227 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-11P01762 117 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 PRH1P02810 166 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ARL3P36405 182 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CAV2P51636 162 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RAB31Q13636 194 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RAB32Q13637 225 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 C10orf99Q6UWK7 81 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 S100A7AQ86SG5 101 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 UBAC2Q8NBM4 344 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR11H1Q8NG94 326 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR10P1Q8NGE3 313 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC20Q8TCA0 184 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ST8SIA2Q92186 375 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 RCHY1Q96PM5 261 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 OR5B12Q96R08 314 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 CITED4Q96RK1 184 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 ASCL2Q99929 193 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 GGACTQ9BVM4 153 aa6□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms