RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CTIF-209ENST00000591387 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CTIF-209ENST00000591387 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CTIF-209ENST00000591387 SMCO1Q147U7 214 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-209ENST00000591387 PYDC2Q56P42 97 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-209ENST00000591387 PRSS54Q6PEW0 395 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-209ENST00000591387 LILRB2Q8N423 598 aa13.3□□□□□ -0.28
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CTIF-209ENST00000591387 CSTL1Q9H114 145 aa13.3□□□□□ -0.28
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CTIF-209ENST00000591387 V9GYH0 126 aa13.28□□□□□ -0.28
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CTIF-209ENST00000591387 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
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CTIF-209ENST00000591387 HELTA6NFD8 242 aa13.25□□□□□ -0.29
CTIF-209ENST00000591387 K7EQG2 157 aa13.25□□□□□ -0.29
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CTIF-209ENST00000591387 GLMPQ8WWB7 406 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-209ENST00000591387 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CTIF-209ENST00000591387 PFDN2Q9UHV9 154 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-209ENST00000591387 SACSQ9NZJ4 4579 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-209ENST00000591387 BUB3O43684 328 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-209ENST00000591387 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-209ENST00000591387 PSG1P11464 419 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-209ENST00000591387 RAB11AP62491 216 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-209ENST00000591387 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-209ENST00000591387 PMS2P11Q13670 270 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-209ENST00000591387 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-209ENST00000591387 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
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