RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 P0C879 139 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 SRPXP78539 464 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 LRTM2Q8N967 370 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 MITD1Q8WV92 249 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 PRR13Q9NZ81 148 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 A0A0B4J2A0 478 aa8.87□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 MT-CO2P00403 227 aa8.87□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 PRCDQ00LT1 54 aa8.87□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 Q6ZNX1 250 aa8.87□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 LGI3Q8N145 548 aa8.87□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.87□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 CSTL1Q9H114 145 aa8.87□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 MPTX1A8MV57 137 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 DEFB4AO15263 64 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 IGKV1-5P01602 117 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 MFAP4P55083 255 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 COQ8AQ8NI60 647 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 ST8SIA2Q92186 375 aa8.86□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 ALG5Q9Y673 324 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.86□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.86□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.85□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 ATG12O94817 140 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 PRR20EP86478 221 aa8.85□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.85□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 OR4A16Q8NH70 328 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 TXN2Q99757 166 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.85□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 FBXL17Q9UF56 701 aa8.85□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 A0A0G2JRQ6 117 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.84□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 ADAP1O75689 374 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 DFFBO76075 338 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 HOXB5P09067 269 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 AKR1C2P52895 323 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 NMSQ5H8A3 153 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.84□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 VSIRQ9H7M9 311 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.84□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GU03 582 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 ST8SIA3O43173 380 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 SSNA1O43805 119 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 DEFB131AP59861 70 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 FAM219AQ8IW50 185 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 GPR146Q96CH1 333 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 AARDQ4LEZ3 155 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZRM9 215 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 Q8NAQ8 132 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CTIF-208ENST00000590422 GINS3Q9BRX5 216 aa8.82□□□□□ -1
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