RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 PARP11Q9NR21 331 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD4-210ENST00000590061 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.78□□□□□ -1.48
SMAD4-210ENST00000590061 TEX22C9J3V5 150 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 H0YIZ8 118 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 FCN1O00602 326 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFA7O95182 113 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 ELANEP08246 267 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 CNTFRP26992 372 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 OPRK1P41145 380 aa5.77□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 PAX9P55771 341 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 RAB2AP61019 212 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 RAB14P61106 215 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 WT1-ASQ06250 92 aa5.77□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 TEX38Q6PEX7 206 aa5.77□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 TMEM219Q86XT9 240 aa5.77□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.77□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.77□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.77□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 C15orf62A8K5M9 175 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 G3V3Q6 166 aa5.76□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 SEC11BP0C7V7 166 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 AKR1C1Q04828 323 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 ATP5G2Q06055 141 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 CD69Q07108 199 aa5.76□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.76□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.76□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 C16orf95Q9H693 158 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.76□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.76□□□□□ -1.492e-7■□□□□ 8.6
SMAD4-210ENST00000590061 VPS13CQ709C8 3753 aa5.76□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 SMLR1H3BR10 107 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V0E1O15342 81 aa5.75□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 AMY1AP04745 511 aa5.75□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.75□□□□□ -1.49
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SMAD4-210ENST00000590061 OR4X1Q8NH49 305 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 FBXL17Q9UF56 701 aa5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 ZFHX3Q15911 3703 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 SMCO3A2RU48 225 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 ZFP92A6NM28 416 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 INAFM1C9JVW0 142 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 GNG7O60262 68 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V1G1O75348 118 aa5.74□□□□□ -1.49
SMAD4-210ENST00000590061 CLN5O75503 358 aa5.74□□□□□ -1.49
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