RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T8A6NH00 312 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 HMSDA8MTL9 139 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FGF7P21781 194 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10J1P30954 320 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.674e-6■■■□□ 16.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35B1P78383 322 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 DLK1P80370 383 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF90Q03938 601 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 BAXQ07812 192 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 OPCMLQ14982 345 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 AWAT1Q58HT5 328 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 STX12Q86Y82 276 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB13Q8WXK3 278 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35E1Q96K37 410 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 HYLS1Q96M11 299 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 MGST2Q99735 147 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5SQ99766 215 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP57Q9NU63 452 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.65□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM89A2RUT3 159 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT19A8MXV4 375 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL2L11O43521 198 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2C1O95371 312 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 CFDP00746 253 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SLURP1P55000 103 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXE3Q13461 319 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 MIC13Q5XKP0 118 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX38Q6PEX7 206 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 BTNL8Q6UX41 500 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 NECAP1Q8NC96 275 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM68Q96MH6 324 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 DOK5Q9P104 306 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF580Q9UK33 172 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.64□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0D9SG52 128 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM223BA6NKX1 122 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP92A6NM28 416 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 BMPR1BO00238 502 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 AGPAT2O15120 278 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 GNG7O60262 68 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 CLN5O75503 358 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1-17P01599 117 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC3BP05452 202 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ELANEP08246 267 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLC1P0CG04 106 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP6V0CP27449 155 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A11P31949 105 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL3P36405 182 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 MFAP4P55083 255 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 HBG1P69891 147 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 HBG2P69892 147 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF345Q14585 488 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 VWC2Q2TAL6 325 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 KLK9Q2XQG4 91 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 BPIFCQ8NFQ6 507 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 RAX2Q96IS3 184 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 VSIRQ9H7M9 311 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.63□□□□□ -1.67
CAPNS1-208ENST00000589162 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.63□□□□□ -1.67
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