RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4C46A6NHA9 309 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 A6NNC1 897 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 FSTL3O95633 263 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RBP4P02753 201 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TCL1AP56279 114 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PLGLAQ15195 96 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB125Q8N687 156 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 OR9G1Q8NH87 305 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PRO3102Q9H379 93 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 A6NDN8 102 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 F2Z2F3 143 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SIVA1O15304 175 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 AGFG2O95081 481 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 THBDP07204 575 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CD59P13987 128 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 ARF6P62330 175 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 Q56UQ5 140 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC13O75165 2243 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GUT8 65 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SHISA9B4DS77 424 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFB8O95169 186 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TCRAP04437 139 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A10P0DMU9 189 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLL1P15814 213 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE6HQ13956 83 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 VAMP3Q15836 100 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01545Q5VT33 79 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 NPIPB3Q92617 1050 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 DOCK7Q96N67 2140 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PGPA6NDG6 321 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R1B8 84 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNHIT1O43257 154 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SPRY3O43610 288 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFB3O43676 98 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SPINK4O60575 86 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CEACAM4O75871 244 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-46P01743 117 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1-16P04430 117 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 COX8AP10176 69 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 GP9P14770 177 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CD33P20138 364 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 COL8A1P27658 744 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00205P59089 165 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RBPJQ06330 500 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 HES3Q5TGS1 186 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 Q86TA4 180 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 PIFOQ8TCI5 191 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 AP1S3Q96PC3 154 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 NGBQ9NPG2 151 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP290O15078 2479 aa6.22□□□□□ -1.41
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