RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-39P04432 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 S100A8P05109 93 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CBLN1P23435 193 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RND3P61587 244 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 Q8N1Y9 231 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MISP3Q96FF7 219 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SEC22AQ96IW7 307 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TP53RKQ96S44 253 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 DBX1A6NMT0 343 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TGOLN2O43493 480 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM6P0DI80 62 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 LYL1P12980 280 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 EDN2P20800 178 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CD81P60033 236 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 KLK9Q2XQG4 91 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf46Q504U0 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TM4SF20Q53R12 229 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SPINK9Q5DT21 86 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RNF141Q8WVD5 230 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ENY2Q9NPA8 101 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0B4J2A0 478 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 COLCA2A8K830 154 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF785A8K8V0 405 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 YIF1AO95070 293 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CD7P09564 240 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SNCAP37840 140 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MFAP2P55001 183 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PRCDQ00LT1 54 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 LYG2Q86SG7 212 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR2C3Q8N628 320 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35G3Q8N808 338 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR1P1Q8NH06 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 THAP6Q8TBB0 222 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MITD1Q8WV92 249 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 RCHY1Q96PM5 261 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 PRRT1Q99946 306 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM213A2RRL7 107 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf52A6NGY3 159 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR11H12B2RN74 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 K7EIM0 57 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2CO00762 179 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ST8SIA3O43173 380 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-5P01602 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-48P01763 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 OR5AC1P0C628 307 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ADCYAP1P18509 176 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 AKR1D1P51857 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 MFAP4P55083 255 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 BLOC1S1P78537 153 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS2Q13268 280 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-214ENST00000583153 BTNL8Q6UX41 500 aa6.28□□□□□ -1.4
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