RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578706.5

UBB-208, Transcript of ubiquitin B, human

TSL 3

Gene UBB, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBB-208	ENST00000578706	FGF7	P21781	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IL3RA	P26951	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HTR1D	P28221	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF137P	P52743	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DLX6	P56179	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LINC00205	P59089	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR2B8P	P59922	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RAB11A	P62491	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC35B1	P78383	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DLK1	P80370	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		H7C2Y5	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		J3QR06	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	UPK2	O00526	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KBTBD11	O94819	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LY6G6C	O95867	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CD1B	P29016	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	NPBWR1	P48145	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	INSL3	P51460	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CCL20	P78556	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ICAM4	Q14773	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RHEB	Q15382	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	UTF1	Q5T230	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PKD1	P98161	4303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		A0A1B0GV50	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		H0YJW9	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CYB5B	O43169	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC25A17	O43808	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	BCL2	P10415	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	NPY1R	P25929	384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MC5R	P33032	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OPRK1	P41145	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PRRX1	P54821	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HAGH	Q16775	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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