RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1-17P01599 117 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL15P1P0C7V9 234 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10J1P30954 320 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1S2Q8NGQ3 325 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIF1AO95070 293 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8G2PQ6IF36 304 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEDDO75618 318 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 TM4SF20Q53R12 229 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf24Q9BUV8 137 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV1-51P01701 117 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 RLN2P04090 185 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOLR2P14207 255 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCL3P19876 107 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBLN1P23435 193 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCAP31P51572 246 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAV2P51636 162 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIGITQ495A1 244 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10P1Q8NGE3 313 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARC2Q969Z3 335 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EMT4 169 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNKO75909 580 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 EDN2P20800 178 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOMM20LQ6UXN7 152 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP10-11P60412 298 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCN2Q15485 313 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR11H7Q8NGC8 314 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFAND3Q9H8U3 227 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 SORL1Q92673 2214 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP92A6NM28 416 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf88P0DMB2 117 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAPLN4Q86UW8 402 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 DYNLRB2Q8TF09 96 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 GINS3Q9BRX5 216 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM24AA6NFZ4 105 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PET100P0DJ07 73 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLK1P80370 383 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 E5RGE8 158 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 THAP8Q8NA92 274 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8WTZ3 238 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5AC2Q9NZP5 309 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNDC10F2Z333 226 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YIZ8 118 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPC2O95563 127 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1C1Q04828 323 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM252Q8N6L7 170 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOMM40O96008 361 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFA6Q01524 100 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL16Q0P5N6 197 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2K2Q8NGT1 345 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGV9Q99603 122 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGACTQ9BVM4 153 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CST7O76096 145 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 RD3LP0DJH9 198 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB114Q30KQ6 69 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM144Q7Z5S9 345 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX12Q86Y82 276 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMCO3A2RU48 225 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 FABP1P07148 127 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RY1P47900 373 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT1A1P50225 295 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGSF23A1L1A6 192 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASB13Q8WXK3 278 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLXQ9UH92 298 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSG1P11464 419 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCN12Q6JVE5 192 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPVFQ9HCQ7 196 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMPXQ9UHP9 88 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF90Q03938 601 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC38A11Q08AI6 406 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTNL8Q6UX41 500 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM217Q8N7C4 229 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51G1Q8NGK1 321 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF126Q9BV68 326 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A31Q9H0C2 315 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL4P05112 153 aa25.02■■□□□ 1.6
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