RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 ULBP3Q9BZM4 244 aa2.84□□□□□ -1.95
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GDE1-202ENST00000563645 MANBALQ9NQG1 85 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 COMMD9Q9P000 198 aa2.84□□□□□ -1.95
GDE1-202ENST00000563645 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
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GDE1-202ENST00000563645 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
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GDE1-202ENST00000563645 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.83□□□□□ -1.96
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GDE1-202ENST00000563645 PITX3O75364 302 aa2.82□□□□□ -1.96
GDE1-202ENST00000563645 DPM2O94777 84 aa2.82□□□□□ -1.96
GDE1-202ENST00000563645 NCR2O95944 276 aa2.82□□□□□ -1.96
GDE1-202ENST00000563645 IGHG1P01857 330 aa2.82□□□□□ -1.96
GDE1-202ENST00000563645 MT-ND6P03923 174 aa2.82□□□□□ -1.96
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