RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	FHIT	P49789	147 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	DYNLT3	P51808	116 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	HES1	Q14469	280 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	PSG5	Q15238	335 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	LY6E	Q16553	131 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	NMS	Q5H8A3	153 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP14	Q86UN6	197 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	NPB	Q8NG41	125 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf52	Q96A22	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	CXorf58	Q96LI9	332 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	OR2A7	Q96R45	310 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	RNF5	Q99942	180 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	FBXL15	Q9H469	300 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	RAB18	Q9NP72	206 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	TACC2	O95359	2948 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	ITPR3	Q14573	2671 aa		3.4	□□□□□ -1.86
LINS1-210	ENST00000560934	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		H3BUX3	64 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CHST1	O43916	411 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	KBTBD11	O94819	623 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IFNA21	P01568	189 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OPN1MW	P04001	364 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	AKR1C2	P52895	323 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2K	P61086	200 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	BLCAP	P62952	87 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SRPX	P78539	464 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	AANAT	Q16613	207 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS8	Q16651	343 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TEX29	Q8N6K0	151 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		Q8N9W7	124 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RASL10A	Q92737	203 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf50	Q96LR7	162 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RCHY1	Q96PM5	261 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CLCC1	Q96S66	551 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	BET1L	Q9NYM9	111 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	COMMD9	Q9P000	198 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TNC	P24821	2201 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GW64	132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934		G3V3Q6	166 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	NBR2	O15453	112 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	CCNK	O75909	580 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SNAPC5	O75971	98 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ATG12	O94817	140 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OR2F2	O95006	317 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFA3	O95167	84 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM50A	O95807	157 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A6	P12236	298 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGDIB	P52566	201 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	OR2B8P	P59922	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	RIG	Q13278	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	SMCO1	Q147U7	214 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	FXYD3	Q14802	87 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LINS1-210	ENST00000560934	MMD	Q15546	238 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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